Clara für Genomik

Die Sotware-Suite NVIDIA Clara™ für Genomik bietet eine noch nie dagewesene Geschwindigkeit und Genauigkeit in der Präzisionsgenomik.

Schnelle, genaue und skalierbare Lösungen für bioinformatische Workflows

NVIDIA Parabricks

Beschleunigung der Genomik-Analyse

NVIDIA® Parabricks® ist eine skalierbare Genomik-Software-Suite für die Sekundäranalyse, die GPU-beschleunigte Versionen von vertrauenswürdigen Open-Source-Tools bietet.

Parabricks ist mit führenden Sequenzierungsinstrumenten kompatibel und kann von Forschern, Bioinformatikern und Datenwissenschaftlern in verschiedenen bioinformatischen Workflows eingesetzt werden.

Parabricks erhöht die Geschwindigkeit mit schnelleren Laufzeiten und reduziert die Kosten – bei gleichzeitiger Verbesserung der Genauigkeit und Gewährleistung der Transparenz. Dadurch können Forscher biologische Erkenntnisse und Entdeckungen schneller aufdecken.

NVIDIA Parabricks: Beschleunigte Genomik-Analyse
NVIDIA AI Blueprints

NVIDIA AI Blueprints

Einfache Bereitstellung von Keimbahn- und Einzelzelllösungen

NVIDIA AI Blueprints sind leichte, einfach bereitstellbare Blueprints für die Keimbahn- und Einzelzellanalyse.

AI Blueprints wurden für Bioinformatiker und Anbieter von Genomik-Plattformen entwickelt und ermöglichen es Benutzern, NVIDIA Parabricks und NVIDIA RAPIDS™ – einschließlich RAPIDS-Einzelzelle, entwickelt von scverse – einfach bereitzustellen und zu testen, ohne dass GPUs oder Bereitstellungen in der Cloud erforderlich sind. 

Durch die einfache Evaluierung und Erweiterung der Zugänglichkeit von Bibliotheken für beschleunigte Genomik können Wissenschaftler und Forscher das genomische Verständnis durch eine schnellere Inbetriebnahme vorantreiben.

NVIDIA NIM Microservices

Optimierung des Abgleichs und des Variantenaufrufs

NVIDIA NIM™ Microservices sind produktionsreife, optimierte und zusammensetzbare Microservices mit FQ2BAM für den Abgleich und DeepVariant für den universellen Variantenaufruf.

Datenwissenschaftler und Entwickler können mit branchenüblichen APIs, die die Erstellung und Bereitstellung von Cloud-nativen Anwendungen erleichtern, auf die neuesten Fortschritte in der generativen KI zugreifen.

Reduzieren Sie zeitaufwendige Analysen. Der produktionsbereite, branchenübliche Abgleich erfolgt in Minuten statt in Stunden. Optimieren Sie außerdem die Leistung des Variantenaufrufs aus verschiedenen Sequenzierungsplattformen.

NVIDIA NIM Microservices erkunden

Gute Gründe für Clara für Genomik

Für Unternehmen

Verkürzen Sie die Zeit bis zur Entdeckung und Identifizierung von Behandlungen mit optimierten Workflows erheblich.

Für IT

Verwandeln Sie den Zeitaufwand für aufwändige Analysen von Tagen auf Minuten und revolutionieren Sie die Geschwindigkeit, Genauigkeit und den Durchsatz von Genomik-Workflows.

Für Entwickler

Optimieren Sie das Alignment, die Verarbeitung und das Varianten-Calling ganzer Genome und Exome sowohl für Keimbahn- als auch somatische Workflows.

Beschleunigen Sie die Genomanalyse von Anfang bis Ende.

Der Genomikmarkt umfasst verschiedene Methoden, die ein breites Anwendungsspektrum in der Medikamentenentwicklung, Präzisionsmedizin, Bevölkerungsgesundheitsstudien und der klinischen Diagnostik abdecken. Die Genomiklandschaft ist vielfältig und umfasst Forschungseinrichtungen, Gesundheitseinrichtungen, Sequenzierungs-Diagnosezentren, nationale Programme, Pharmazeutika und Techbios, die alle eine wesentliche Rolle bei der Entdeckung der Genomik spielen. Schnellere Analysen führen zu schnelleren Diagnosen, personalisierten Behandlungen und einer optimierten Medikamentenentwicklung, was Zeit und Ressourcen spart, gleichzeitig die Patientenversorgung verbessert und datengestützte Entscheidungen in Echtzeit ermöglicht.

Beschleunigte Short-Read-Analyse

Die Short-Read-Sequenzierung erzeugt kurze DNA-Sequenzen und wird wegen ihrer Schnelligkeit und Wirtschaftlichkeit geschätzt. NVIDIA® Parabricks® beschleunigt Goldstandard-Tools für die sekundäre Analyse, von der Ausrichtung bis zum Variantenaufruf, und ermöglicht die schnelle Analyse von Short-Read-Sequenzierungsdaten. Diese Tools können mit Daten von Element, Illumina, MGI, Singular und Thermo Fisher verwendet werden.

Beschleunigte Short-Read-Analyse

Zusätzliche Technologien

NVIDIA RAPIDS, eine Open-Source-Suite mit GPU-beschleunigten Datenwissenschafts- und KI-Bibliotheken

NVIDIA RAPIDS

NVIDIA RAPIDS ist eine Open-Source-Suite mit GPU-beschleunigten Datenwissenschafts- und KI-Bibliotheken, die die Leistung in Datenpipelines verbessert.

Die Softwareplattform für KI im Produktivbetrieb

NVIDIA AI Enterprise

NVIDIA AI Enterprise ist eine Softwareplattform für Kunden, die Unterstützung für Parabricks in klinischen Workflows, großen Sequenzierungsprojekten und Plattformen mit hohem Durchsatz benötigen.

NIM Microservices für Genomik

Die NVIDIA NIM™ Microservices bieten eine umfassende, mehrschichtige Lösung für KI-Inferenzen, die die Leistungsfähigkeit vorgefertigter Container, branchenüblicher APIs, benutzerdefinierter Modellunterstützung, domänenspezifischer Codes und optimierter Inferenzmaschinen kombiniert. Verwenden Sie die NIM Microservices nach Belieben, um Ihren eigenen Arbeitsablauf für individuelle Genomik-Anwendungen zu erstellen.

Deepvariant

Deepvariant

Führen Sie den für GPUs optimierten DeepVariant von Google aus. Switch-Modelle für hohe Genauigkeit auf allen wichtigen Sequenzern.

fq2bam

fq2bam

Generierung von BAM-Ausgaben mit einem oder mehreren FASTQ-Dateipaaren durch Ausführen der Best Practices für BWA-MEM und GATK.

NVIDIA Parabricks

NVIDIA Parabricks bietet grafikkartenbeschleunigte Versionen von Tools, die täglich von Systembiologen und Bioinformatikern verwendet werden, was deutlich schnellere Laufzeiten, eine bessere Skalierbarkeit der Arbeitsabläufe und geringere Rechenkosten ermöglicht.

 NVIDIA Parabricks

NVIDIA AI Enterprise

Für Kunden, die Unterstützung für Parabricks in klinischen Arbeitsabläufen, große Sequenzierungsprojekte, Plattformen mit hohem Durchsatz oder andere Workflows, die sofortige Hilfe benötigen, bietet NVIDIA AI Enterprise an.

Vergleichen Sie die Vorteile von Parabricks mit NVIDIA AI Enterprise

Erfolgsgeschichten

Räumliche Transkriptomik verändert das Gesundheitswesen

Räumliche Transkriptomik verändert das Gesundheitswesen

Vier Branchenführer treiben die Erforschung und Prävention von Krankheiten voran

PacBio

PacBio

Höhere Genauigkeit und Schnelligkeit der Long-Read-Sequenzierung mit Pacific Biosciences 

TGEN

TGEN

Reduzierung des Zeitaufwands für Einzelzell- und räumliche Analyse von Stunden auf Minuten beim Translational Genomics Research Institute 

Das Francis Crick Institute

Das Francis Crick Institute

Einsparung von neun Jahren Verarbeitungszeit mit NVIDIA Parabricks

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Dokumentation

Im Parabricks Documentation Hub finden Sie eine Sammlung von Dokumenten, Anleitungen, Handbüchern, How-Tos und anderen Informationsressourcen. Greifen Sie auf On-Demand-Sitzungen und Schulungen für Entwickler zu.

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Beschleunigung der Produktions-KI mit Parabricks und NVIDIA AI Enterprise

Forschung

Perfekt für Forscher:innen und Studierende..

Enterprise

Perfekt für kommerzielle und Unternehmensorganisationen.Perfekt für Forscher:innen und Studierende.

Merkmale

Beschleunigte Tools
GPU-beschleunigte Bioinformatik-Tools mit Goldstandard für Hochgeschwindigkeits- und kostengünstige Analysen.
   
Workflows mit hohem Durchsatz
Flexible und skalierbare Workflows für die Montage von Tools in Pipelines, die den Durchsatz maximieren.
   
Unterstützung für Community-Foren
Community-Support über das NVIDIA Parabricks Developers Forum.
   
Support für Full-Stack und geschäftskritische Bereiche
Support der Enterprise-Klasse für mehrere Bereitstellungsoptionen – Bare Metal, containerisiert, Cloud und mehr
   
Sicherheit der Enterpriseklasse
Kontinuierliche Überwachung auf Schwachstellen und regelmäßiges, zeitnahes Sicherheitspatching von kritischen, häufigen Schwachstellen und Gefahrenpotenzial.
   
Sicherheitsbenachrichtigungen
Vorrangige Benachrichtigungen zu den neuesten Sicherheitsfixes und Wartungsreleases.
   
Kontakt zu NVIDIA-Expert:innen
Anleitung zur optimierten Konfiguration und Leistung, einschließlich Kontakt zu versierten NVIDIA-Techniker:innen.
   
Enterprise-Schulungsservices
Workshops mit Schulungsleiter:innen und Schulungen im selbstbestimmten Tempo für Entwickler:innen, Datenwissenschaftler:innen und IT-Expert:innen.
   
Support für andere NVIDIA-Software und -SDKs
DIE NVIDIA AI Enterprise-Software umfasst auch den Support für viele andere NVIDIA-Produkte, darunter MONAI, NVIDIA RAPIDS™, TensorRT™ und mehr.
   
  Kostenlos

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