Die NVIDIA-Software-Suite Clara™ für Genomik bietet beispiellose Geschwindigkeit und Genauigkeit in der Präzisionsgenomik.
Verkürzen Sie die Zeit bis zur Entdeckung und Identifizierung von Behandlungen mit optimierten Workflows erheblich.
Verwandeln Sie den Zeitaufwand für aufwändige Analysen von Tagen auf Minuten und revolutionieren Sie die Geschwindigkeit, Genauigkeit und den Durchsatz von Genomik-Workflows.
Optimieren Sie das Alignment, die Verarbeitung und das Varianten-Calling ganzer Genome und Exome sowohl für Keimbahn- als auch somatische Workflows.
Der Genomikmarkt umfasst verschiedene Methoden, die ein breites Anwendungsspektrum in der Medikamentenentwicklung, Präzisionsmedizin, Bevölkerungsgesundheitsstudien und der klinischen Diagnostik abdecken. Die Genomiklandschaft ist vielfältig und umfasst Forschungseinrichtungen, Gesundheitseinrichtungen, Sequenzierungs-Diagnosezentren, nationale Programme, Pharmazeutika und Techbios, die alle eine wesentliche Rolle bei der Entdeckung der Genomik spielen. Schnellere Analysen führen zu schnelleren Diagnosen, personalisierten Behandlungen und einer optimierten Medikamentenentwicklung, was Zeit und Ressourcen spart, gleichzeitig die Patientenversorgung verbessert und datengestützte Entscheidungen in Echtzeit ermöglicht.
Die Short-Read-Sequenzierung erzeugt kurze DNA-Sequenzen und wird wegen ihrer Schnelligkeit und Wirtschaftlichkeit geschätzt. NVIDIA® Parabricks® beschleunigt Goldstandard-Tools für die sekundäre Analyse, von der Ausrichtung bis zum Variantenaufruf, und ermöglicht die schnelle Analyse von Short-Read-Sequenzierungsdaten. Diese Tools können mit Daten von Element, Illumina, MGI, Singular und Thermo Fisher verwendet werden.
Long-Read-Sequenzierung ist entscheidend für die Identifizierung struktureller Varianten und kann verwendet werden, um Genome aus mehreren Proben zusammenzusetzen, was die Erforschung der genetischen Vielfalt in Populationen vorantreiben kann. NVIDIA Parabricks beschleunigt erstklassige sekundäre Analysetools für Basecalling, Alignment und Variant Calling und ermöglicht so eine schnelle Analyse von Long-Read-Sequenzdaten. Diese Tools können mit Daten von Oxford Nanopore- und PacBio-Long-Read-Sequenzern verwendet werden.
NVIDIA RAPIDS™ beschleunigt Single-Cell-Workflows für die Datenverarbeitung und Visualisierung mit einem ähnlichen Usability-Modell wie die Python-Bibliotheken von scverse. cunnData stellt eine minimierte, schlanke Version des AnnData-Objekts für die Grafikkarte bereit, die eine schnelle Datenmanipulation und -verarbeitung ermöglicht, die RAPIDS cuGraph und cuML-Bibliotheken dann nachgelagert analysieren können.
NVIDIA Parabricks beinhaltet einen Einzelzellen- und räumlichen Workflow, um kritische Prozessabschnitte zu beschleunigen und die Genauigkeit zu erhöhen. Generative KI wird speziell auf die räumliche Analyse mit VISTA-2D angewendet, einem Zellbildgebungs-Grundmodell für hochgenaue Segmentierung. Als Deep Learning-Algorithmus, der auf Transformern basiert, arbeitet VISTA-2D mit mehreren Zelltypen und unterstützt mehrere Datenbestände, Modalitäten und GPUs.
NVIDIA Parabricks bietet grafikkartenbeschleunigte Versionen von Tools, die täglich von Systembiologen und Bioinformatikern verwendet werden, was deutlich schnellere Laufzeiten, eine bessere Skalierbarkeit der Arbeitsabläufe und geringere Rechenkosten ermöglicht.
RAPIDS ist eine Suite von Open-Source-Bibliotheken, die durch Grafikkartenbeschleunigung End-to-End-Workflows für die Datenwissenschaft beschleunigen können. RAPIDS ermöglicht die Durchführung interaktiver Datenanalysen großer Datensätze mithilfe von Python-APIs.
NVIDIA Parabricks ist als Set von Containern und vortrainierten Modellen auf NVIDIA NGC™ und DGX™ Cloud erhältlich. Mit dem Kauf von NVIDIA AI Enterprise erhalten Sie vollen Zugang zum Unternehmenssupport, einschließlich garantierter Reaktionszeiten, vorrangiger Sicherheitsbenachrichtigungen und Zugang zu Parabricks-Experten.
Einsparung von neun Jahren Verarbeitungszeit mit NVIDIA Parabricks
Höhere Genauigkeit und Schnelligkeit der Long-Read-Sequenzierung mit Pacific Biosciences
Reduzierung des Zeitaufwands für Einzelzell- und räumliche Analyse von Stunden auf Minuten beim Translational Genomics Research Institute
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