Visit your regional NVIDIA website for local content, pricing, and where to buy partners specific to your country.
Die Sotware-Suite NVIDIA Clara™ für Genomik bietet eine noch nie dagewesene Geschwindigkeit und Genauigkeit in der Präzisionsgenomik.
Verkürzen Sie die Zeit bis zur Entdeckung und Identifizierung von Behandlungen mit optimierten Workflows erheblich.
Verwandeln Sie den Zeitaufwand für aufwändige Analysen von Tagen auf Minuten und revolutionieren Sie die Geschwindigkeit, Genauigkeit und den Durchsatz von Genomik-Workflows.
Optimieren Sie das Alignment, die Verarbeitung und das Varianten-Calling ganzer Genome und Exome sowohl für Keimbahn- als auch somatische Workflows.
Der Genomikmarkt umfasst verschiedene Methoden, die ein breites Anwendungsspektrum in der Medikamentenentwicklung, Präzisionsmedizin, Bevölkerungsgesundheitsstudien und der klinischen Diagnostik abdecken. Die Genomiklandschaft ist vielfältig und umfasst Forschungseinrichtungen, Gesundheitseinrichtungen, Sequenzierungs-Diagnosezentren, nationale Programme, Pharmazeutika und Techbios, die alle eine wesentliche Rolle bei der Entdeckung der Genomik spielen. Schnellere Analysen führen zu schnelleren Diagnosen, personalisierten Behandlungen und einer optimierten Medikamentenentwicklung, was Zeit und Ressourcen spart, gleichzeitig die Patientenversorgung verbessert und datengestützte Entscheidungen in Echtzeit ermöglicht.
Die Short-Read-Sequenzierung erzeugt kurze DNA-Sequenzen und wird wegen ihrer Schnelligkeit und Wirtschaftlichkeit geschätzt. NVIDIA® Parabricks® beschleunigt Goldstandard-Tools für die sekundäre Analyse, von der Ausrichtung bis zum Variantenaufruf, und ermöglicht die schnelle Analyse von Short-Read-Sequenzierungsdaten. Diese Tools können mit Daten von Element, Illumina, MGI, Singular und Thermo Fisher verwendet werden.
Long-Read-Sequenzierung ist entscheidend für die Identifizierung struktureller Varianten und kann verwendet werden, um Genome aus mehreren Proben zusammenzusetzen, was die Erforschung der genetischen Vielfalt in Populationen vorantreiben kann. NVIDIA Parabricks beschleunigt erstklassige sekundäre Analysetools für Basecalling, Alignment und Variant Calling und ermöglicht so eine schnelle Analyse von Long-Read-Sequenzdaten. Diese Tools können mit Daten von Oxford Nanopore- und PacBio-Long-Read-Sequenzern verwendet werden.
NVIDIA RAPIDS™ beschleunigt Single-Cell-Workflows für die Datenverarbeitung und Visualisierung mit einem ähnlichen Usability-Modell wie die Python-Bibliotheken von scverse. cunnData stellt eine minimierte, schlanke Version des AnnData-Objekts für die Grafikkarte bereit, die eine schnelle Datenmanipulation und -verarbeitung ermöglicht, die RAPIDS cuGraph und cuML-Bibliotheken dann nachgelagert analysieren können.
NVIDIA Parabricks beinhaltet einen Einzelzellen- und räumlichen Workflow, um kritische Prozessabschnitte zu beschleunigen und die Genauigkeit zu erhöhen. Generative KI wird speziell auf die räumliche Analyse mit VISTA-2D angewendet, einem Zellbildgebungs-Grundmodell für hochgenaue Segmentierung. Als Deep Learning-Algorithmus, der auf Transformern basiert, arbeitet VISTA-2D mit mehreren Zelltypen und unterstützt mehrere Datenbestände, Modalitäten und GPUs.
Die NVIDIA NIM™ Microservices bieten eine umfassende, mehrschichtige Lösung für KI-Inferenzen, die die Leistungsfähigkeit vorgefertigter Container, branchenüblicher APIs, benutzerdefinierter Modellunterstützung, domänenspezifischer Codes und optimierter Inferenzmaschinen kombiniert. Verwenden Sie die NIM Microservices nach Belieben, um Ihren eigenen Arbeitsablauf für individuelle Genomik-Anwendungen zu erstellen.
Führen Sie den für GPUs optimierten DeepVariant von Google aus. Switch-Modelle für hohe Genauigkeit auf allen wichtigen Sequenzern.
Generierung von BAM-Ausgaben mit einem oder mehreren FASTQ-Dateipaaren durch Ausführen der Best Practices für BWA-MEM und GATK.
NVIDIA Parabricks bietet grafikkartenbeschleunigte Versionen von Tools, die täglich von Systembiologen und Bioinformatikern verwendet werden, was deutlich schnellere Laufzeiten, eine bessere Skalierbarkeit der Arbeitsabläufe und geringere Rechenkosten ermöglicht.
Für Kunden, die Unterstützung für Parabricks in klinischen Arbeitsabläufen, große Sequenzierungsprojekte, Plattformen mit hohem Durchsatz oder andere Workflows, die sofortige Hilfe benötigen, bietet NVIDIA AI Enterprise an.
Vergleichen Sie die Vorteile von Parabricks mit NVIDIA AI Enterprise
Vier Branchenführer treiben die Erforschung und Prävention von Krankheiten voran
Höhere Genauigkeit und Schnelligkeit der Long-Read-Sequenzierung mit Pacific Biosciences
Reduzierung des Zeitaufwands für Einzelzell- und räumliche Analyse von Stunden auf Minuten beim Translational Genomics Research Institute
Einsparung von neun Jahren Verarbeitungszeit mit NVIDIA Parabricks
NVIDIA Parabricks ist eine GPU-beschleunigte Software-Suite für die sekundäre Genomanalyse. Parabricks ist mit allen führenden Sequenzierungsinstrumenten kompatibel und unterstützt verschiedene bioinformatische Workflows.
Parabricks erhöht die Geschwindigkeit, senkt die Kosten und steigert die Genauigkeit der sekundären Genomanalyse.
Ja, Parabricks stimmt mit den Ergebnissen von Open-Source-Tools überein, sodass Sie Open-Source-Tools auswechseln können und mit Parabricks die exakt gleichen Ergebnisse erzielen. Die neuesten Benchmarks aus der Version 4.3.1 finden Sie in der folgenden Tabelle.
Ausführungszeit in Minuten. 30-mal gesamtes Genom sequenziert für FQ2BAM, BWA-Meth, DeepVariante und Haplotype Caller mit Illumina-Daten. 50-mal gesamtes tumornormales Genom sequenziert für Mutect2 mit Illumina-Daten.
Parabricks ist als öffentlicher Container in NVIDIA NGC™ für die Verwendung vor Ort oder in der Cloud beliebiger Plattformen oder Anbieter verfügbar.
Parabricks können bei öffentlichen Cloud-Anbietern, auf Plattformen und bei Partnern sowie vor Ort ausgeführt werden.
Hardware-Anforderungen
Softwareanforderungen
Parabricks wird von den meisten NVIDIA GPUs für Unternehmen unterstützt, darunter A100, A6000, A40, A30, A10, L40, T4 und V100 Tensor Core GPUs.
Bitte kontaktieren Sie uns mit Ihrer Frage.
Abonnieren Sie die News aus dem Gesundheitswesen – von spannenden Produktveröffentlichungen bis zu wichtigen Neuigkeiten.
Haben Sie Fragen? Unsere Experten für den Gesundheitssektor helfen Ihnen gerne weiter!
Perfekt für Forscher:innen und Studierende..
Perfekt für kommerzielle und Unternehmensorganisationen.Perfekt für Forscher:innen und Studierende.
Optional
NVIDIA-Datenschutzrichtlinie