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Potencia una velocidad y una precisión sin precedentes en genómica de precisión con la suite de software NVIDIA Clara™ for Genomics.
Reduce sustancialmente el tiempo de descubrimiento e identificación de tratamientos con flujos de trabajo optimizados.
Transforma los análisis que consumen mucho tiempo de días a minutos para revolucionar la velocidad, la precisión y el rendimiento de los flujos de trabajo genómicos.
Optimiza la alineación, el procesamiento y la llamada de variantes de genomas y exomas completos para flujos de trabajo somáticos y de línea germinal.
El mercado de la genómica abarca varios métodos que abarcan una amplia gama de aplicaciones en el descubrimiento de fármacos, la medicina de precisión, los estudios de salud de la población y el diagnóstico clínico. El panorama es diverso e incluye instituciones de investigación, instalaciones sanitarias, centros de diagnóstico de secuenciación, programas nacionales, productos farmacéuticos y tecnobios, todos los cuales desempeñan un papel esencial en los descubrimientos genómicos. Un análisis más rápido conduce a un diagnóstico más rápido, tratamientos personalizados y un descubrimiento de fármacos optimizado, lo que ahorra tiempo y recursos al tiempo que mejora la atención al paciente y permite tomar decisiones basadas en datos en tiempo real.
La secuenciación de lectura corta genera secuencias de ADN cortas y es valorada por su velocidad y asequibilidad. NVIDIA® Parabricks® mejora las herramientas de análisis secundario estándar de referencia, desde la alineación hasta la llamada de variantes, y permite un análisis rápido de datos de secuenciación de lectura corta. Estas herramientas se pueden utilizar con datos de Element, Illumina, MGI, Singular y Thermo Fisher.
La secuenciación de lectura larga es fundamental para identificar variantes estructurales y se puede utilizar para ensamblar genomas de múltiples muestras, lo que puede impulsar el estudio de la diversidad genética en poblaciones. NVIDIA Parabricks acelera las herramientas de análisis secundario estándar de oro para llamadas base, alineación y llamadas de variantes, lo que permite un análisis rápido de datos de secuenciación de lectura larga. Estas herramientas se pueden utilizar en datos de secuenciadores de lectura larga de Oxford Nanopore y PacBio.
NVIDIA RAPIDS™ acelera los flujos de trabajo de una sola celda para el procesamiento y la visualización de datos, con un modelo de usabilidad similar al de las bibliotecas Phyton scverse. cunnData proporciona una versión minimizada y ligera del objeto AnnData para la GPU, lo que permite una rápida manipulación y procesamiento de datos, que las bibliotecas cuGraph y cuML de RAPIDS pueden analizar después.
NVIDIA Parabricks incluye un flujo de trabajo espacial y de una sola célula para acelerar los cuellos de botella. La IA generativa se aplica específicamente al análisis espacial con VISTA-2D, un modelo básico de obtención de imágenes celulares para conseguir una segmentación de alta precisión. Como es un algoritmo de deep learning basado en transformadores, VISTA-2D funciona en diversos tipos de células y admite múltiples conjuntos de datos, modalidades y unidades GPU.
NVIDIA Parabricks proporciona versiones aceleradas por GPU de herramientas utilizadas todos los días por biólogos computacionales y bioinformáticos, lo que permite tiempos de ejecución significativamente más rápidos, escalabilidad del flujo de trabajo y menores costes informáticos.
RAPIDS es un conjunto de bibliotecas de código abierto que puede acelerar los flujos de trabajo de ciencia de datos de extremo a extremo gracias a la potencia de la aceleración por GPU. RAPIDS permite realizar análisis de datos interactivos en grandes conjuntos de datos mediante las API de Python.
NVIDIA Parabricks está disponible como un conjunto de contenedores y modelos entrenados previamente de NVIDIA NGC™ y DGX™ Cloud. La compra del software NVIDIA AI Enterprise viene con acceso completo al soporte empresarial, que incluye tiempos de respuesta garantizados, notificaciones de seguridad prioritaria y acceso a expertos en Parabricks.
Ahorro de nueve años de tiempo de procesamiento con NVIDIA Parabricks
Aumentando la precisión y la velocidad de la secuenciación de lectura larga con Pacific Biosciences
Reducción del análisis unicelular y espacial de horas a minutos con el centro Translational Genomics Research Institute
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