Visit your regional NVIDIA website for local content, pricing, and where to buy partners specific to your country.
El poder de una velocidad y precisión sin precedentes en la genómica de precisión con el conjunto de software NVIDIA Clara™ para genómica.
Reduce sustancialmente el tiempo de descubrimiento e identificación de tratamientos con flujos de trabajo optimizados.
Transforma los análisis que consumen mucho tiempo de días a minutos para revolucionar la velocidad, la precisión y el rendimiento de los flujos de trabajo genómicos.
Optimiza la alineación, el procesamiento y la llamada de variantes de genomas y exomas completos para flujos de trabajo somáticos y de línea germinal.
El mercado de la genómica abarca varios métodos que abarcan una amplia gama de aplicaciones en el descubrimiento de fármacos, la medicina de precisión, los estudios de salud de la población y el diagnóstico clínico. El panorama es diverso e incluye instituciones de investigación, instalaciones sanitarias, centros de diagnóstico de secuenciación, programas nacionales, productos farmacéuticos y tecnobios, todos los cuales desempeñan un papel esencial en los descubrimientos genómicos. Un análisis más rápido conduce a un diagnóstico más rápido, tratamientos personalizados y un descubrimiento de fármacos optimizado, lo que ahorra tiempo y recursos al tiempo que mejora la atención al paciente y permite tomar decisiones basadas en datos en tiempo real.
La secuenciación de lectura corta genera secuencias de ADN cortas y es valorada por su velocidad y asequibilidad. NVIDIA® Parabricks® mejora las herramientas de análisis secundario estándar de referencia, desde la alineación hasta la llamada de variantes, y permite un análisis rápido de datos de secuenciación de lectura corta. Estas herramientas se pueden utilizar con datos de Element, Illumina, MGI, Singular y Thermo Fisher.
La secuenciación de lectura larga es fundamental para identificar variantes estructurales y se puede utilizar para ensamblar genomas de múltiples muestras, lo que puede impulsar el estudio de la diversidad genética en poblaciones. NVIDIA Parabricks acelera las herramientas de análisis secundario estándar de oro para llamadas base, alineación y llamadas de variantes, lo que permite un análisis rápido de datos de secuenciación de lectura larga. Estas herramientas se pueden utilizar en datos de secuenciadores de lectura larga de Oxford Nanopore y PacBio.
NVIDIA RAPIDS™ acelera los flujos de trabajo de una sola celda para el procesamiento y la visualización de datos, con un modelo de usabilidad similar al de las bibliotecas Phyton scverse. cunnData proporciona una versión minimizada y ligera del objeto AnnData para la GPU, lo que permite una rápida manipulación y procesamiento de datos, que las bibliotecas cuGraph y cuML de RAPIDS pueden analizar después.
NVIDIA Parabricks incluye un flujo de trabajo espacial y de una sola célula para acelerar los cuellos de botella. La IA generativa se aplica específicamente al análisis espacial con VISTA-2D, un modelo básico de obtención de imágenes celulares para conseguir una segmentación de alta precisión. Como es un algoritmo de deep learning basado en transformadores, VISTA-2D funciona en diversos tipos de células y admite múltiples conjuntos de datos, modalidades y unidades GPU.
Los microservicios NVIDIA NIM™ ofrecen una solución completa en capas para la inferencia de IA, que combina la potencia de los contenedores preconstruidos, API estándar del sector, soporte de modelos personalizados, código específico del dominio y motores de inferencia optimizados. Utilice los microservicios NIM a la carta para crear su propio flujo de trabajo para aplicaciones genómicas personalizadas.
Ejecute DeepVariant de Google optimizado para GPU. Cambie entre modelos para mejorar la precisión en todos los secuenciadores principales.
Genere resultados BAM a partir de uno o más pares de archivos FASTQ, ejecutando las prácticas recomendadas de BWA-MEM y GATK.
NVIDIA Parabricks proporciona versiones aceleradas por GPU de herramientas utilizadas todos los días por biólogos computacionales y bioinformáticos, lo que permite tiempos de ejecución significativamente más rápidos, escalabilidad del flujo de trabajo y menores costes informáticos.
Para clientes que necesiten asistencia para Parabricks en flujos de trabajo clínicos, proyectos de secuenciación de gran tamaño, plataformas de alto rendimiento u otros flujos de trabajo que requieran asistencia inmediata, NVIDIA ofrece NVIDIA AI Enterprise.
Compare las ventajas de Parabricks con NVIDIA AI Enterprise
Cuatro líderes avanzan en investigación y prevención de enfermedades
Aumentando la precisión y la velocidad de la secuenciación de lectura larga con Pacific Biosciences
Reducción del análisis unicelular y espacial de horas a minutos con el centro Translational Genomics Research Institute
Ahorro de nueve años de tiempo de procesamiento con NVIDIA Parabricks
NVIDIA Parabricks es una suite de software acelerado por GPU para análisis genómico secundario. Parabricks es compatible con todos los principales instrumentos de secuenciación y admite diversos flujos de trabajo bioinformáticos.
Parabricks aumenta la velocidad, reduce el coste y aumenta la precisión del análisis genómico secundario.
Sí, Parabricks iguala los resultados de las herramientas de código abierto, por lo que puede abandonar el resto de herramientas de código abierto y obtener exactamente los mismos resultados con Parabricks. Los análisis de referencia más recientes, de la versión 4.3.1, se pueden encontrar en la tabla siguiente.
Tiempo de rendimiento en minutos. 30 veces el genoma completo secuenciado para FQ2BAM, BWA-Meth, DeepVariant y Haplotype Caller con datos de Illumina. 50 veces el genoma completo normal del tumor secuenciado para Mutect2 con datos de Illumina.
Parabricks está disponible como contenedor público en NVIDIA NGC™ para su uso en las instalaciones o en cualquier plataforma o proveedor de servicios en la nube.
Parabricks se puede ejecutar en proveedores de nube pública, plataformas y partners, así como en las instalaciones.
Requisitos de hardware
Requisitos de software
Parabricks es compatible con la mayoría de las GPU NVIDIA para empresas, incluidas las GPU A100, A6000, A40, A30, A10, L40, T4 y V100 con núcleo Tensor.
Póngase en contacto con nosotros con su pregunta.
Suscríbete a las noticias de salud: desde lanzamientos de productos interesantes hasta actualizaciones imprescindibles.
¿Tienes alguna pregunta? ¡Nuestros expertos en atención sanitaria están aquí para ayudarte!
La mejor opción para investigadores y estudiantes.
Ideal para organizaciones comerciales y empresariales
opcional
Política de privacidad de NVIDIA