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Análisis Acelerado de Secuenciación del Genoma Completo

Experimenta la secuenciación de ADN y ARN de alto rendimiento y alta precisión con el análisis acelerado por GPU.

Descargar

NVIDIA Clara^™ Parabricks^® es el único kit de herramientas de genómica computacional acelerado en la GPU que proporciona análisis rápidos y precisos para centros de secuenciación, equipos clínicos, investigadores genómicos y desarrolladores de instrumentos de secuenciación de nueva generación.

Ver documento: Hoja de producto de Parabricks (PDF 304 kB)

Acelera las aplicaciones con las mejores herramientas de su clase.

Utiliza herramientas aceleradas para el análisis de ARN, somático y de línea germinal estándar del oro a velocidad.

Obtén un rendimiento hasta 80 veces más rápido.

Experimenta aceleraciones hasta 80 veces mayores en comparación con las soluciones solo de CPU, lo que reduce los costos de computación hasta en un 50%.

Mejora la precisión en el análisis de secuenciación.

Aprovecha la potencia de deep learning en tu análisis genómico con Clara Parabricks y las GPU.

Aprovecha los workflows flexibles.

Crea workflows personalizados configurando herramientas en Workflow Description Language (WDL) y NextFlow.

Acelerar el Análisis Genómico de Principio a Fin

Utilice las Herramientas Gold-Standard

Clara Parabricks proporciona versiones aceleradas por GPU de herramientas utilizadas todos los días por biólogos computacionales y bioinformáticos, lo que permite tiempos de ejecución significativamente más rápidos, escalabilidad de workflows y menores costos de computación.

Esto incluye la compatibilidad total con los lenguajes de workflow y los administradores (WDL, NextFlow, Cromwell) para entrelazar fácilmente las tareas impulsadas por GPU y CPU, así como la compatibilidad para una fácil implementación en cloud (AWS, GCP, Terra y DNAnexus).

FASTQ a Binary Alignment Map (BAM) a VCF

Experimente un Rendimiento Inigualable

Desde FastQ hasta Variant Call Format (VCF), Clara Parabricks acelera los tiempos de ejecución en una serie de configuraciones de hardware con las GPU NVIDIA A100 Tensor Core. Los investigadores genómicos pueden experimentar la aceleración en cada paso de sus workflows de análisis, desde la alineación hasta el ordenamiento y la detección de variantes. Cuando se usan más GPU, se observa una escala casi lineal en los tiempos de computación, en comparación con los sistemas solo de CPU, lo que permite una aceleración de más de 80 veces.

Analiza Todo un Genoma Humano con una Cobertura 30 Veces Mayor en Menos de 30 Minutos

Los tiempos de ejecución de NVIDIA se lograron con un sistema NVIDIA DGX™ A100 de 320 GB. Todos los análisis se ejecutaron en HG002 Genome In A Bottle (GIAB NIST) secuenciado con una cobertura 30 veces mayor, con detecciones de variantes hechas con GATKv4.1.0 HaplotypeCaller.

Introducción a NVIDIA Clara Parabricks

Encuentra el camino adecuado para ti.

Investigación

NVIDIA Clara Parabricks está disponible como un conjunto de contenedores y modelos preentrenados de NVIDIA NGC. Descarga NVIDIA Clara Parabricks y consulta la documentación y los flujos de trabajo que te ayudarán a empezar.

Enterprise

Utilice NVIDIA Clara Parabricks con el software NVIDIA AI Enterprise para obtener acceso completo al soporte empresarial que proporciona tiempos de respuesta garantizados, notificaciones de seguridad prioritarias y expertos en IA de NVIDIA. Para obtener más información, póngase en contacto con ventas.

Más Información

Implantación Local, en el Cloud y en el Edge

Construir en las Instalaciones

Clara Parabricks se ejecuta en una NVIDIA DGX™ A100 y analiza hasta 25,000 genomas completos por año (cobertura de 30 veces) con las mejores prácticas de Genomic Analysis Toolkit (GATK), con un rendimiento que se escala linealmente más allá de una sola DGX A100.

Más Información sobre DGX A100

Implantar en el Cloud

En el cloud, el tiempo es dinero. Elige entre una gama de instancias de GPU capaces de analizar genomas en cuestión de minutos. Para facilitar la implementación, varios proveedores de cloud alojan Clara Parabricks como una imagen lista para usarse de forma inmediata.

Explorar AWS Marketplace

Explorar Google Cloud Platform (GCP)

Explorar Terra

Llevar la IA al Edge

Colaboramos con fabricantes de instrumentos genómicos para permitir la creación de secuenciadores de ADN definidos por software y habilitados para IA, transcripciones espaciales y otros dispositivos sísmicos, lo que mejora la precisión y permite el análisis en tiempo real en el edge.

Comunícate con el Equipo de NVIDIA Genomics para Obtener Más Información

Acelera tu viaje hacia la IA con NVIDIA LaunchPad

Obtén acceso inmediato a las soluciones empresariales de NVIDIA con un laboratorio práctico gratuito en Clara Parabricks para acelerar el análisis genómico.

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Impacto en el Mundo Real

Análisis a Escala
En Secuenciadores y Dispositivos
Para la Investigación de Vanguardia

El Instituto Broad

NVIDIA está colaborando con Broad para llevar Parabricks acelerados por GPU a la Plataforma Terra, además de optimizar los workflows acelerados por IA y los grandes modelos de idiomas para avanzar en el descubrimiento.

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El Biobanco Nacional de Tailandia Acelera los Descubrimientos Genómicos

Biobanco Nacional de Tailandia (NBT)

NBT redujo su procesamiento de datos de secuenciación del genoma completo en cuatro meses y su tiempo de procesamiento de usuario individual de más de 30 horas a solo 1– 2 horas con NVIDIA DGX A100 y Clara Parabricks.

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Instituto de Investigación en Genómica Traslacional (TGen)

El Centro del Genoma Humano (HGC)

HGC de la Universidad de Tokio anunció una nueva plataforma genómica para acelerar el análisis genómico en 40 veces, en comparación con un entorno basado en CPU, que utiliza el software genómico NVIDIA Clara Parabricks Pipelines.

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Centro de Genética Regeneron

Regeneron está utilizando DeepVariant con Clara Parabricks para generar datos escalables y de alta calidad que se pueden reproducir en toda la comunidad genómica.

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Ultima

Ultima Genomics está colaborando con NVIDIA para lograr la secuenciación genómica de $100 con IA y computación acelerada.

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Singular

Singular Genomics colabora con NVIDIA para ofrecer velocidades de análisis y secuenciación de próxima generación líderes en el mercado.

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Dispositivo MinIT, impulsado por NVIDIA AGX

Oxford Nanopore

Oxford Nanopore está actualizando a su torre de computación PromethION, de la NVIDIA V100 a la tecnología A100, este aumento de la potencia de procesamiento le permitirá mantenerse al día con una base de alta precisión y ampliar en gran medida la capacidad para algoritmos de supercomputación.

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Crédito de la imagen: Steve Fisch, cortesía de la Universidad de Stanford.

Récord Mundial Guinness

Un equipo de investigadores logró un nuevo récord de secuenciación de ADN (cinco horas y dos minutos), que permitirá a los médicos extraer sangre de un paciente de atención crítica y alcanzar un diagnóstico de trastorno genético el mismo día.

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Secuenciación del Genoma Ultrrárapida a cargo de Nanopore en una Atención Crítica

Universidad de Stanford, Google y Oxford Nanopore

Stanford ha logrado enormes reducciones en el tiempo de ejecución al integrar la implementación acelerada por GPU de DeepVariant disponible con NVIDIA Clara Parabricks.

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Framework de computación acelerado por GPU para la variante genómica de patógenos

Universidad Purdue

Los investigadores de Purdue completaron un estudio que evalúa el rendimiento y la precisión de un framework de computación acelerado por GPU para la identificación de variantes genómicas de patógenos.

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