Clara pour la génomique

Profitez d'une vitesse et d'une précision sans précédent dans le domaine de la génomique de précision grâce à la suite logicielle NVIDIA Clara™ pour la génomique.

Solutions rapides, précises et évolutives pour les workflows de bioinformatique

NVIDIA Parabricks

Accélérez l'analyse génomique

NVIDIA® Parabricks® est une suite logicielle de génomique évolutive pour l'analyse secondaire qui fournit des versions accélérées par GPU d'outils open source fiables.

Compatible avec les principaux instruments de séquençage, les chercheurs, les bioinformaticiens et les data scientists peuvent utiliser Parabricks dans divers workflows de bioinformatique.

Parabricks augmente la vitesse avec des temps d'exécution plus courts et réduit les coûts, tout en améliorant la précision et en garantissant la transparence. Les chercheurs peuvent ainsi découvrir et comprendre plus rapidement les mécanismes biologiques.

NVIDIA Parabricks : analyse génomique accélérée
Modèles d'IA de NVIDIA

Modèles d'IA de NVIDIA

Déployez facilement des solutions à lignée germinale et à cellule unique

Les modèles d'IA de NVIDIA sont des modèles légers et facilement déployables pour l'analyse de lignée germinale et de cellules individuelles.

Conçus pour les bioinformaticiens et les fournisseurs de plateformes de génomique, les modèles d'IA permettent aux utilisateurs de déployer et de tester facilement NVIDIA Parabricks et NVIDIA RAPIDS™, y compris RAPIDS monocellulaire développé par scverse, sans nécessiter de GPU ni de provisions Cloud. 

En évaluant et en élargissant facilement l'accessibilité des bibliothèques de génomique accélérée, les scientifiques et les chercheurs peuvent approfondir leur compréhension de la génomique en étant opérationnels plus rapidement.

NVIDIA NIM Microservices

Optimisez l'alignement et l'appel de variantes

Les microservices NVIDIA NIM™ sont prêts pour la production, optimisés et composables avec FQ2BAM pour l'alignement et DeepVariant pour l'appel universel de variantes.

Les data scientists et les développeurs peuvent accéder aux dernières avancées de l'IA générative avec des API aux normes de l'industrie qui facilitent la création et le déploiement d'applications cloud-natives.

Réduisez les analyses chronophages. L'alignement standard de l'industrie prêt pour la production s'effectue en quelques minutes au lieu de plusieurs heures. Optimisez en outre les performances de l'appel de variantes à partir de différentes plateformes de séquençage.

 Explorez les microservices NVIDIA NIM

Pourquoi choisir Clara pour la génomique ?

Pour les entreprises

Réduisez les délais de découverte et d’identification des traitements avec des workflows optimisés.

Pour les services informatiques

Réduisez les délais des procédures d’analyse chronophage à quelques minutes seulement et renforcez la vitesse, la précision et le rendement des workflows de génomique.

Pour les développeurs

Optimisez l’alignement, le traitement et les appels de génomes et d’exomes entiers pour les workflows dédiés aux variantes somatiques et germinales.

Accélérez l’analyse génomique de bout en bout

Le secteur de la génomique englobe différentes méthodes pour des applications variées allant de la recherche pharmaceutique à la médecine de précision en passant par les études sur la santé des populations ou les diagnostics cliniques. Ce milieu regroupe de nombreux acteurs tels que des instituts de recherche, des établissements de santé, des centres de diagnostic et de séquençage, des programmes nationaux, des laboratoires pharmaceutiques et des sociétés de la bio-industrie jouant tous un rôle essentiel dans les découvertes en génomique. L’accélération des analyses permet d’améliorer les diagnostics, de personnaliser les traitements et de rationaliser la recherche pharmaceutique, ce qui aide les professionnels à économiser du temps et des ressources tout en améliorant la prise en charge des patients et en permettant des décisions en temps réel reposant sur les données.

Analyse accélérée par GPU de séquences courtes

Le séquençage court, qui contribue à générer de courtes séquences d’ADN, est vivement apprécié pour sa rapidité et son accessibilité. NVIDIA® Parabricks® accélère les outils d'analyse secondaire de référence, de l'alignement aux appels de variantes, ce qui permet d'analyser rapidement les données de séquençage court. Ces outils peuvent être utilisés avec les données d'Element, Illumina, MGI, Singular et Thermo Fisher.

Analyse accélérée par GPU de séquences courtes

Technologies supplémentaires

NVIDIA RAPIDS, une suite open source de bibliothèques de Data Science et d'IA accélérées par GPU

NVIDIA RAPIDS

NVIDIA RAPIDS est une suite open source de bibliothèques de Data Science et d'IA accélérées par GPU qui améliore les performances des pipelines de données.

Plateforme logicielle pour l'IA de production

NVIDIA AI Enterprise

NVIDIA AI Enterprise est une plateforme logicielle pour les clients qui ont besoin d'une assistance pour Parabricks pour les workflows cliniques, les grands projets de séquençage et les plateformes à haut débit.

Suite de produits

Les microservices NVIDIA NIM™ offrent une solution d'inférence de l'IA complète et en couches, combinant la puissance de conteneurs préconçus, des API standard du secteur, la prise en charge de modèles personnalisés, du code spécifique au domaine et des moteurs d'inférence optimisés. Utilisez les microservices NIM à la carte pour créer votre workflow d'applications génomiques personnalisées.

DeepVariant

DeepVariant

Exécutez DeepVariant de Google optimisé pour le GPU. Changez de modèle pour améliorer la précision sur tous les principaux séquenceurs.

fq2bam

fq2bam

Générez des sorties BAM avec une ou plusieurs paires de fichiers FASTQ, en exécutant les meilleures pratiques BWA-MEM et GATK.

NVIDIA Parabricks

NVIDIA Parabricks fournit des versions accélérées par GPU d’outils utilisés au quotidien par les biologistes computationnels et les bioinformaticiens, ce qui permet de réduire les délais d’exécution et les coûts de calcul, tout en optimisant l’évolutivité.

 NVIDIA Parabricks

NVIDIA AI Enterprise

Pour les clients qui ont besoin d'assistance pour Parabricks dans les workflows cliniques, les grands projets de séquençage, les plateformes à haut débit et d'autres workflows nécessitant une assistance immédiate, NVIDIA propose NVIDIA AI Enterprise.

Comparez les avantages de Parabricks avec NVIDIA AI Enterprise

Études de cas

L'Institut Francis Crick

L'Institut Francis Crick

Gain de neuf ans de temps de traitement avec NVIDIA Parabricks

PacBio

PacBio

Accroître la précision et de vitesse du séquençage long avec Pacific Biosciences 

TGEN

TGEN

Réduire le traitement de l'analyse spatiale et unicellulaire de quelques heures à quelques minutes grâce au Translational Genomics Research Institute 

L'Institut Francis Crick

L'Institut Francis Crick

Gain de neuf ans de temps de traitement avec NVIDIA Parabricks

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Documentation

Parcourez une collection de documents, de guides, de manuels, de didacticiels et d'autres ressources d'information relatives à Parabricks. Accédez à des sessions et à des formations à la demande pour les développeurs.

Mises à jour des produits

Découvrez les dernières actualités concernant les produits pour la génomique : nouvelles versions, corrections de bugs, mises à jour de sécurité essentielles, et bien plus encore.

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Vous avez des questions ? Nos experts de la santé sont là pour vous aider.

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Accélérer l'IA de production avec Parabricks et NVIDIA AI Enterprise

Recherche

Optimal pour les organisations commerciales et d'entreprise.

Entreprise

Optimal pour les chercheurs et les étudiants.

Caractéristiques

Outils accélérés
Outils bioinformatiques de référence accélérés par GPU pour réaliser des analyses à haute vitesse et à faible coût.
   
Workflows haut débit
Workflows flexibles et évolutifs pour assembler des outils dans des pipelines qui maximisent le débit.
   
Assistance du forum de la communauté
Assistance de la communauté par le biais du forum des développeurs NVIDIA Parabricks..
   
Assistance sur la pile entière et critique aux activités
Assistance de niveau entreprise avec de nombreuses options de déploiement : Bare-Metal, conteneurisé, Cloud, etc..
   
Fonctions de sécurité d’entreprise
Surveillance permanente des vulnérabilités et installation régulière et rapide de correctifs de sécurité des vulnérabilités et des expositions critiques et communes.
   
Avis de sécurité
Notifications prioritaires sur les derniers correctifs de sécurité et mises à jour de maintenance.
   
Accès aux experts de NVIDIA
Conseils relatifs à l’optimisation des configurations et des performances avec un accès aux experts en ingénierie de NVIDIA.
   
Services de formation pour les entreprises
Ateliers dirigés par des instructeurs agréés et formations à la carte pour les développeurs, les data scientists et les professionnels de l’informatique.
   
Prise en charge d'autres logiciels et kits de développement NVIDIA
L’environnement logiciel NVIDIA AI Enterprise prend également en charge de nombreux autres produits de NVIDIA comme MONAI, NVIDIA RAPIDS™, TensorRT™ et plus encore.
   
  Gratuit

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