Velocità e precisione senza precedenti nella genomica di precisione con la suite software NVIDIA Clara™ for Genomics.
Riduzione significativa dei tempi di ricerca e identificazione dei trattamenti con flussi di lavoro ottimizzati.
Riduzione dei tempi di analisi da giorni a minuti per migliorare velocità, accuratezza e produttività dei flussi di lavoro genomici.
Ottimizzazione dell'allineamento, dell'elaborazione e delle chiamate delle varianti di interi genomi ed esomi per flussi di lavoro germinali e somatici.
Il mercato della genomica abbraccia vari metodi che coinvolgono un'ampia gamma di applicazioni nella ricerca farmacologica, nella medicina di precisione, negli studi sulla salute della popolazione e nella diagnostica clinica. Il panorama è eterogeneo e include istituti di ricerca, strutture sanitarie, centri di diagnostica del sequenziamento, programmi nazionali, prodotti farmaceutici e di biotecnologia, che ricoprono tutti un ruolo essenziale nelle scoperte genomiche. Un'analisi più rapida porta a diagnosi più rapide, trattamenti personalizzati e ricerca farmacologica semplificata, il che consente di risparmiare tempo e risorse, migliorando la cura dei pazienti e favorendo decisioni basate sui dati in tempo reale.
Il sequenziamento a lettura breve genera brevi sequenze di DNA ed è particolarmente apprezzato per la sua velocità e convenienza. NVIDIA® Parabricks® migliora lo standard degli strumenti di analisi secondaria, dall'allineamento alla chiamata delle varianti, consentendo l'analisi rapida dei dati di sequenziamento a lettura breve. Questi strumenti possono essere utilizzati con i dati di Element, Illumina, MGI, Singular e Thermo Fisher.
Il sequenziamento a lettura lunga è fondamentale per identificare varianti strutturali e può essere utilizzato per assemblare genomi da più campioni, che possono guidare lo studio della diversità genetica nelle popolazioni. NVIDIA Parabricks accelera gli strumenti di analisi secondarie gold-standard per basecalling, allineamento e chiamata delle varianti, consentendo l'analisi rapida di dati di sequenziamento a lettura lunga. Questi strumenti possono essere utilizzati sui dati dei sequenziatori Oxford Nanopore e PacBio a lettura lunga.
NVIDIA RAPIDS™ accelera i flussi di lavoro a cella singola per l'elaborazione e la visualizzazione dei dati, con un modello di usabilità simile alle librerie Scverse Python. cunnData fornisce una versione ridotta a icona e leggera dell'oggetto AnnData per la GPU, consentendo la manipolazione ed elaborazione rapida dei dati, che le librerie RAPIDS cuGraph e cuML possono quindi analizzare a valle.
NVIDIA Parabricks include un flusso di lavoro a cella singola e spaziale in grado di ridurre i ritardi e offrire una maggiore precisione. L’IA generativa è applicata in modo specifico all’analisi spaziale con VISTA-2D, un modello di base di imaging cellulare per la segmentazione ad alta precisione. Trattandosi di un algoritmo di deep learning basato su trasformatori, VISTA-2D lavora su più tipi di celle e supporta più set di dati, modalità e GPU.
NVIDIA Parabricks fornisce versioni accelerate da GPU degli strumenti utilizzati ogni giorno da biologi computazionali e bioinformatici, consentendo runtime significativamente più veloci, scalabilità del flusso di lavoro e costi di calcolo più bassi.
RAPIDS è una suite di librerie open source in grado di accelerare i flussi di lavoro di scienza dei dati end-to-end grazie alla potenza dell'accelerazione con GPU. RAPIDS consente di eseguire analisi dei dati interattive su set di dati di grandi dimensioni utilizzando le API Python.
NVIDIA Parabricks è disponibile come set di container e modelli pre-addestrati, sul catalogo NVIDIA NGC™ e DGX™ Cloud. L'acquisto di NVIDIA AI Enterprise include l'accesso completo al supporto aziendale che offre tempi di risposta garantiti, avvisi di sicurezza in anteprima e l'accesso agli esperti di Parabricks.
Nove anni di elaborazione risparmiati con NVIDIA Parabricks
Aumentare la precisione e la velocità del sequenziamento a lettura lunga con Pacific Biosciences
Ridurre l'analisi spaziale e a cellule singole da ore a minuti con Translational Genomics Research Institute
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