アクセラレーテッド コンピューティングによるゲノム研究で先進技術を活用する
ゲノム検査がより主流になりつつある中、32 億個の DNA 塩基対の配列を決定することは、病気を引き起こす可能性のある変異を特定するために不可欠な作業です。ハイスループット機器の進化により配列解析の費用は減少しましたが、解析が必要なデータ量も増加させました。GPU を活用してこの解析を加速することで、CPU ベースのアプローチと比べて実行時間と費用を大幅に削減できます。
NVIDIA DGX™ システムを搭載した Group 42 のスーパーコンピューターは、アラブ首長国連邦の国民の全遺伝情報を把握し、国内の医療を改善するため、研究者を支援しています。
Wellcome Sanger Institute と UC San Diego の研究者は NVIDIA と共同で、体細胞突然変異シグネチャの解析を NVIDIA DGX システムで 30 倍に加速することに取り組みました。
Translational Genomics Research Institute は最も効果のある治療方法を迅速に開発するため、GPU のパワーを利用することで、希少な神経疾患のある子供のゲノム配列を 1 日未満で解析します。
ウイルスのシークエンシングは、ウイルスを特徴付けるのに役立ち、また医療従事者がウイルスの識別、変異、伝染について把握することを支援します。GPU を活用した分析ソフトウェアを使用する Oxford Nanopore のシークエンス制御装置が、現在進行中のコロナウイルス感染症の動向把握と研究にどのように利用されているかご覧ください。
NVIDIA Clara™ Parabricks の最新リリースでは、最新の機能に加えてパフォーマンスが改善されています。生産上の生殖細胞系列、体細胞系列、RNA のバリアントコール パイプラインを高速化し、すぐにご利用いただけるソリューションをご確認ください。
NVIDIA Clara Parabricks は、ゲノム解析のための既製ソリューションの完全なポートフォリオであり、新しいアプリケーション開発のための開発者用ツールキットを備えています。Clara Parabricks は、DNA から RNA までの解析と、一次解析、二次解析、三次解析向けのアプリケーションワークフローに対応しながら、高速化、精度、スケーラビリティを最適化するよう構築されています。
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