유전체학용 NVIDIA Clara™ 소프트웨어 제품군으로 정밀 유전체학에서 획기적인 속도와 정확도를 달성하세요.
최적화된 워크플로우를 통해 발견 및 치료 식별에 소요되는 시간을 대폭 단축할 수 있습니다.
시간이 오래 걸리는 분석을 며칠에서 단 몇 분으로 단축하여 유전자 워크플로우의 속도, 정확도 및 처리량을 혁신합니다.
생식선 및 체세포 워크플로우 모두를 위해 전체 유전자 및 엑솜의 정렬, 처리 및 변이 검출을 최적화합니다.
유전체학 시장에는 신약 개발, 정밀 의학, 집단 건강 연구 및 임상 진단 전반에 걸쳐 광범위한 애플리케이션을 포괄하는 여러 가지 방법이 존재합니다. 연구 기관, 헬스케어 시설, 시퀀싱 진단 센터, 국가 프로그램, 제약 및 테크 바이오 등 다양한 환경이 유전체학 발견에서 필수적인 역할을 수행합니다. 더 빠른 분석은 더 빠른 진단, 맞춤형 치료, 간소화된 신약 개발로 이어져 시간과 리소스를 절약하는 동시에 환자 치료를 개선하고 실시간 데이터 기반 의사 결정을 가능하게 합니다.
짧은 읽기 시퀀싱은 짧은 DNA 시퀀스를 생성하며 그 속도와 경제성으로 높이 평가됩니다. NVIDIA® Parabricks®는 정렬에서 변이 검출에 이르기까지 최적의 표준 이차 분석 도구를 가속화하여 짧은 읽기 시퀀싱 데이터를 빠르게 분석할 수 있도록 지원합니다. 이러한 도구는 Element, Illumina, MGI, Singular, Thermo Fisher 및 Ultima 시퀀서의 데이터와 함께 사용할 수 있습니다.
롱 리드 시퀀싱은 구조적 변이를 식별하는 데 중요한 역할을 하고 여러 샘플에서 유전자를 조합하는 데 사용될 수 있으며, 이는 집단의 유전적 다양성 연구를 주도할 수 있습니다. NVIDIA Parabricks는 염기 결정, 정렬 및 변이 검출을 위한 2차 분석 도구를 최적의 표준으로 가속화하여 롱 리드 시퀀싱 데이터를 빠르게 분석할 수 있도록 지원합니다. 이러한 도구는 Oxford Nanopore 및 PacBio 롱 리드 시퀀서의 데이터에 사용할 수 있습니다.
NVIDIA RAPIDS™는 scverse Python 라이브러리와 유사한 사용성 모델을 통해 데이터 처리 및 시각화를 위한 단일 셀 워크플로우를 가속화합니다. cunnData는 GPU용 AnnData 개체의 최소화된 경량 버전을 제공하여 신속한 데이터 조작 및 처리를 지원하며, RAPIDS cuGraph 및 cuML 라이브러리는 다운스트림을 분석할 수 있습니다.
NVIDIA Parabricks는 컴퓨팅 생물학자와 생물정보학자가 항상 사용하는 도구의 GPU 가속 버전을 제공하여 빠른 런타임과 워크플로우 확장성을 실현하고 컴퓨팅 비용을 절감합니다.
RAPIDS는 GPU 가속화의 성능을 통해 엔드 투 엔드 데이터 사이언스 워크플로우의 속도를 높일 수 있는 오픈 소스 라이브러리 제품군입니다. RAPIDS를 사용하면 Python API로 대규모 데이터 세트에 대한 인터랙티브 데이터 분석을 수행할 수 있습니다.
NVIDIA Parabricks는 NVIDIA NGC™ 및 DGX™ 클라우드에서 컨테이너 및 사전 훈련된 모델의 세트로 사용할 수 있습니다. NVIDIA AI Enterprise를 구매하면 보장된 응답 시간, 우선 보안 알림 및 Parabricks 전문가에 대한 액세스를 제공하는 엔터프라이즈 지원을 모두 이용할 수 있습니다.
NVIDIA는 Broad와 협력하여 GPU 가속 Parabricks를 Terra 플랫폼에 제공할 뿐만 아니라 AI 가속 워크플로우 및 대규모 언어 모델을 최적화하여 발견을 앞당기고 있습니다.
NBT는 NVIDIA DGX A100 및 NVIDIA Parabricks를 통해 전체 유전자 염기서열 데이터 처리 기간을 4개월 단축했고, 개별 사용자 처리 시간을 30시간 이상에서 1~2시간으로 줄였습니다.
도쿄 대학의 HGC는 NVIDIA Parabricks Pipelines 유전체학 소프트웨어를 활용하여 CPU 기반 환경에 비해 유전체 분석 속도를 40배 가속화할 수 있는 새로운 유전체학 플랫폼을 발표했습니다.
Regeneron은 NVIDIA Parabricks를 활용하는 DeepVariant를 사용하여 유전체학계 전반에서 재현할 수 있는 확장 가능한 고품질 데이터를 생성하고 있습니다.
Ultima Genomics는 NVIDIA와 협력하여 AI 및 가속 컴퓨팅을 통해 유전자 염기서열 분석을 100달러에 제공하고 있습니다.
Singular Genomics는 NVIDIA와 협력하여 시장을 선도하는 차세대 서열 분석 및 분석 속도를 제공하고 있습니다.
Oxford Nanopore는 PromethION 컴퓨팅 타워를 NVIDIA V100 Tensor 코어 GPU에서 A100 Tensor 코어 GPU로 업그레이드하고 있습니다. 이러한 처리 능력 향상을 통해 높은 정확도의 염기 결정을 따라잡고 초정밀 알고리즘의 용량을 대폭 확장할 수 있습니다.
이미지 제공: Steve Fisch, Stanford University.
연구팀은 5시간 2분이라는 새로운 DNA 서열 분석 기록을 달성하였으며, 이로 인해 임상의는 중환자로부터 혈액을 채취하여 같은 날 유전 질환 진단을 내릴 수 있게 되었습니다.
스탠포드는 NVIDIA Parabricks와 함께 사용할 수 있는 DeepVariant의 GPU 가속 구현을 통합하자 런타임이 크게 줄였음을 입증했습니다.
퍼듀대학교의 연구팀은 병원균 유전체 변이 식별을 위한 GPU 가속 컴퓨팅 프레임워크의 성능과 정확도를 평가하는 연구를 완료했습니다.
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